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张泽民课题组研究成果入选2024年度“中国生物信息学十大进展”


近日,《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文)》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 简称GPB)公布了2024年度“中国生物信息学十大进展”评选结果。北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)张泽民课题组发表在Cell杂志的研究成果“泛癌种B细胞异质性的生物信息学解析”入选。



泛癌种B细胞异质性的生物信息学解析

肿瘤浸润B细胞是多种癌症类型预后以及免疫治疗响应的标志物,但其在不同癌症类型中的异质性尚未得到系统性研究。北京大学张泽民、王东方团队与深圳湾实验室陈敏敏团队基于多癌种单细胞测序数据的系统性生物信息学整合,构建肿瘤原位B细胞成熟和激活的全景图谱,鉴定患者预后相关的关键B细胞亚型。研究发现稀有B细胞亚群肿瘤相关非典型B细胞(TAAB)和CD4 T细胞的互惠激活,揭示了肿瘤微环境免疫调控的新规律,挖掘B细胞作为预后、治疗响应新靶点的潜力。该研究从泛癌种视角为B细胞的异质性及其抗肿瘤免疫反应提供了新的见解,并为未来进一步探索B细胞在癌症中功能的共性和多样性奠定了基础。


推荐理由:构建高质量肿瘤浸润B细胞的泛癌单细胞图谱,为B细胞的异质性及其抗肿瘤免疫反应提供了新的见解



图:生物信息学整合分析揭示表型各异的肿瘤浸润B细胞亚类


数据库链接

http://pan-b.cancer-pku.cn/

原文信息

Yang Y, Chen X, Pan J, Ning H, Zhang Y, Bo Y, et al. Pan-cancer single-cell dissection reveals phenotypically distinct B cell subtypes. Cell 2024;187:4790–4811.e22. PMID: 39047727.

原文链接 

https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.06.038


据悉,GPB组织评选了2018年度、2019年度、2020年度、2021年度、2022年度和2023年度“中国生物信息学十大进展”。今年,经过100余名国内外生物信息学领域专家推荐,初选、复选投票,以及复核程序,GPB评选出2024年度“中国生物信息学十大进展”。


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